燕窩早上吃或晚上吃功效相差不大，吃燕窩主要是為了補充燕窩中的營養成分，燕窩含有較多的唾液蛋白，唾液蛋白也是一種蛋白質，經過胃蛋白酶，以及消化道胰腺分泌的胰蛋白酶進行消化，消化成相應的氨基酸，以及短肽，經過腸黏膜吸收。燕窩中含有礦物質、維生素、無機物等物質，都屬于小分子物質，在腸道里可以被直接吸收，因此早晨或晚上吃，最終吸收的部位都是在小腸，充分的消化也需要在小腸進行。隨著進入小腸，不斷從空腸到回腸，逐漸被消化和吸收，因此燕窩早晨吃和晚上吃，都不會影響營養物質的消化和吸收。