治療腸炎需要辨證施治，需明確是急性腸炎還是慢性腸炎，而且急性和慢性腸炎都要根據觀察疾病的寒熱虛實、八綱辨證、陰陽表里。如果急性腸炎如果表現為濕熱中阻，或者濕熱阻滯，出現腹脹、腹痛、大便溏稀，或者有便膿血、里急后重、便前腹痛便后緩解、舌紅、苔黃膩等，這可能是急性腸炎或急性菌類。此時建議清熱化濕治療，通常用葛根芩連湯、白頭翁湯、芍藥湯等來加減治療。如果是慢性腸炎病人，可能病程較長、反復發作，同時有氣短乏力、面色萎黃或面色蒼白、大便溏稀癥狀，建議健脾益氣治療。如果脾陽不振，還要健脾益氣、溫中散寒治療，健脾益氣采取參苓白術丸的加減治療。如果脾胃虛寒建議采取附子理中丸治療，如果有脾腎陽虛，采取補腎溫陽，可以用四生丸來加減治療。