中毒性細菌性痢疾的致病菌是痢疾桿菌，痢疾桿菌可以釋放很多毒素，患者在出現明顯腹瀉前，毒素已經讓身體發生嚴重病變，比如發生腦病，有頭痛、惡心、嘔吐的癥狀，并且有嚴重的意識喪失，甚至表現為低血壓休克，以上均為中毒性痢疾特征性的臨床表現。中毒性細菌性痢疾常發生在夏秋季節，并且常發生在較大的兒童身上，如7歲以上的兒童。由于沒有腹瀉癥狀，所以不易聯想至菌痢。此時治療的關鍵是及時應用抗菌藥物，如頭孢菌素類藥物或者青霉素類藥物，及時殺滅細菌、清除毒素根源。對于腦病的對癥治療則是降低顱內壓，如發生休克需及時補液。