精子的支原體和衣原體檢查屬于病原學檢查，可以檢測精液中是否存在支原體和衣原體感染。如果存在感染，可根據感染程度確定對何藥物敏感，對于選擇抗生素治療有較大幫助。精液中感染病原體的種類較多，除支原體、衣原體，也可能是細菌、病毒、滴蟲或其他病原微生物。支原體、衣原體感染可選擇使用大環內酯類抗生素，或者四環素類抗生素進行治療，比如阿奇霉素、米諾環素、多西環素、羅紅霉素等，治愈標準為培養呈陰性以及癥狀消失。如果長期存在支原體、衣原體感染，可能導致精子質量下降，是不孕不育的原因之一。如果精液中查出支原體和衣原體，通常配偶應進行相關病原體檢查，否則一方治愈，另一方存在感染，可能會出現交叉感染、反復發作的情況。