空洞型肺結核相比較于其他類型肺結核，如繼發性肺結核，或者沒有空洞的浸潤型肺結核，治療較難。大多數空洞型肺結核，尤其是空洞較小，經過早期、足療程、正規的抗結核治療，空洞可以閉合，病灶可以吸收，可能僅留下少數纖維增殖病灶。一部分空洞型肺結核，由于空洞周圍有結締組織的增生，以至于抗結核藥難以進入空洞內，空洞內的結核桿菌很難被全身抗結核治療所消滅。上述情況下，空洞比較大，伴有大咯血的患者，必要時在全身抗結核治療的同時，需要用手術切除的方法，聯合全身抗結核治療，使其臨床治愈。極少部分空洞型的肺結核，由于感染的病灶局部的損傷嚴重，干酪樣壞死組織的痰液排出，局部可以形成多個薄壁或厚壁的空洞，并伴有周圍結締組織的增生。雖然經過比較長時間，如9個月，甚至9個月以上的全身抗結核治療，空洞內的結核桿菌已經被殺滅，但由于多個空洞，伴有周圍纖維結締組織的增生，以至于形成慢性纖維空洞型肺結核。一旦形成慢性纖維空洞型肺結核，雖然肺結核處于靜止狀態，患者也不具有排菌的傳染性，由于肺功能的損害，會明顯地影響患者的生存質量。慢性纖維空洞型肺結核在呼吸功能不全的基礎上，繼發感染可直接導致呼吸功能不全，可危及患者的生命。慢性纖維空洞型肺結核的患者也可以由于損傷血管，出現大咯血，從而危及患者的生命。因此，大多數空洞型肺結核，經過正規的足療程抗結核治療，可以達到臨床治愈空洞閉合。但不排除少數患者需要接受手術切除，以及極少數患者會留下慢性纖維空洞型肺結核的后遺癥。