食管癌可通過胃鏡檢查結果進行判斷，食管胃鏡加局部病灶的活檢是食管癌診斷的金標準。中晚期食管癌的病灶很大，通過胃鏡的檢出率基本上可達到100%，早期的食管癌起病較隱匿，部分尚未突破食管的黏膜、血管，而胃鏡只能看見表面，所以早期食管癌通過胃鏡的檢出率大概在85%左右。 另外，胃鏡結合碘染不著色區域的活檢可以進一步提高早期食管癌的檢出率。碘能與正常細胞富含的糖原結合，而腫瘤細胞由于糖原消耗過快，糖原含量非常低。碘劑在食管黏膜染色后，正常的細胞為深染色，腫瘤細胞不著色或染色非常淺。對不染色區域進行多點活檢，甚至深部活檢可更早地發現食管癌的臨床表現，所以食管癌結合現有的臨床手段基本能達到100%的檢出率。