做腸鏡檢查可以完整地觀察到大腸的解剖結構，包括直腸、乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸以及回盲部，在回盲部還可以觀察到闌尾的開口，從回盲瓣可以進入到小腸的末端，即回腸的末端。大腸位于橫結腸的兩側，即結腸的肝區跟脾區，通過系膜相對固定，橫結腸及乙狀結腸相對比較游離。再往后是升結腸，然后是回盲部，回盲部與末端的小腸以及闌尾相連。由于腸鏡檢查可以幫助完整地觀察到腸道的各個部分，觀察到整個的腸黏膜是否存在問題，所以大腸的病變，尤其是黏膜的病變，可以完整地在腸鏡直視下觀察到。對于局限在黏膜層或黏膜下層淺層的早期腫瘤，也可以在內鏡下進行切除。