核酸檢測可診斷肺結核，此時核酸檢測針對的是肺結核致病菌，即結核分枝桿菌核酸檢測。病人出現咳嗽、咳痰，將痰液進行檢測發現結核分枝桿菌此類特異性核酸，可作為確診肺結核的依據。核酸實際為結核桿菌特異性的基因片段，此基因片段可等同于確實存在相應細菌感染。從相反角度考慮，病人存在咳嗽、咳痰，此次痰液檢測發現結核桿菌核酸為陰性，陰性結果不能排除疾病可能。肺結核病人痰液中不是每一口痰都存在細菌，無法通過一次檢測確診，一次核酸結果陰性不足以排除病人肺結核診斷。