如果根尖膿腫不進行相應治療，而是任其發展，后果是會導致牙齒根尖區的炎癥堆積，膿腫越來越大，逐漸導致牙槽骨吸收，從牙槽骨突破，表現為牙根、牙齦上形成瘺管，瘺管可能會流膿，此為根尖膿腫不治的初步后果。如果繼續發展，會導致根尖區的牙槽骨形成更大范圍的吸收，逐漸牙齒、牙齦以及牙周纖維會出現慢性炎癥，導致吸收、破裂等，牙齒會出現松動、脫落，此為根尖膿腫不治的最后結果。有些患者還有可能會導致根尖區膿腫擴散，形成周圍組織的感染，如口腔頜面部間隙感染，出現牙槽骨的炎癥、頜骨的骨髓炎等。因此對于根尖膿腫，要盡早進行根管治療。