大部分消化不良的患者可能會偏瘦，尤其是長期消化不良，進食以后容易腹瀉的患者，可能營養素的吸收會較差。人體是否會發胖，與攝入的能量和消耗的能量比有關，如果攝入的能量明顯大于消耗的能量，會形成脂肪，沉積在皮下、肝臟、內臟等位置，出現體型偏胖或者是肥胖。總體而言，消化不良患者發胖的幾率較小。有時認為消化不良，進食以后出現腹瀉是因為脾胃虛所致，大部分脾虛的患者是因為平時飲食負荷過大，脾胃受損。這類患者通常原來體型偏胖，進食寒涼或者是油膩的食物后，可能會腹瀉，所以也可以診斷為消化不良。總之，大部分消化不良的患者可能偏瘦，但也有部分患者本身較胖，也可以出現消化不良。