早晨咳嗽的厲害有以下幾種原因：1、感染性因素：通常由于早晨有排痰的情況出現，夜間呼吸道的分泌物積聚在氣管中，早上起來后由于自身反射機制要將痰排出，則會出現早晨咳嗽厲害的情況；2、非感染性因素：如慢性支氣管炎，由于夜間分泌物潴留，導致晨起咳嗽；3、氣道敏感：早上起來從被子里出來時，會有溫差變化，氣道經過刺激，也會出現咳嗽的情況，與氣道敏感性有關，如慢性支氣管炎、慢性阻塞性肺疾病，以及過敏性疾病，如支氣管哮喘。