直腸檢查主要有以下方式：1、肛門指診：是最基本的檢查，即用手指觸摸肛門，但可以摸到的部位有限；2、結腸鏡：通過結腸鏡可以看到整個大腸，做結腸鏡檢查前，需要喝瀉藥將腸道清干凈，以使結腸鏡看得更清楚；3、影像學檢查：如CT、磁共振等，針對直腸的檢查最常用的是磁共振，因為直腸位于盆腔，而磁共振對于盆腔檢查的分辨率、清晰程度以及重要信息等會更完善；4、其他方式：肛門鏡。