肛瘺手術以后，創面可能會假性愈合，不是真正的愈合。假性愈合的表現為，不按預定時間進行創面愈合，或者未完全愈合，總有所殘留，而殘留部位，可能反復出現分泌物。當手術創面未真正愈合，即使創面完全封閉，但是創面略微隆起，患者經常出現不適感，但不是疼痛，僅為不適，而且觸摸有飽滿感。隨著時間的發展，飽滿感逐漸軟化，可以感覺到創面下有液體存在。在換藥時分開表面，瘡面會有液體流出，為黃白色液體，此時說明是假性愈合。部分患者外表愈合，但是在肛門指診時，在內瘺口位置上觸摸組織無法正常運行，此時提示肛瘺沒有真正愈合。