魚肝油不可以代替維生素D3，因為二者的成分不一樣，所以起到的作用也不完全相同。魚肝油中含有D3，同時還含有維生素A，所以是兩種成分的藥物。魚肝油主要預防和治療維生素A和維生素D缺乏癥，如佝僂病、夜盲癥、小兒手足搐搦癥等。維生素D3的成分比較單一，同時魚肝油是天然產物，從魚類的肝臟中提取出來的脂肪性成分，而維生素D3是人工合成，但維生素D3和魚肝油起到的藥理作用基本類似，其中維生素D3可以促進鈣的吸收，維生素A促進人體生長和發育所必需的物質，所以魚肝油以及維生素A、維生素D類的制劑，對于嬰幼兒的發育，還有上皮組織的完整性以及視力、血鈣、血磷等，以及對于骨骼和牙齒的生長都有非常重要的作用。此兩種藥物成分雖然主要都是維生素補充劑，但需要必須按照推薦劑量服用，如果超量服用，可能引發不良反應。