胃間質瘤一部分能徹底治愈，還有一部分無法徹底治愈，但可以通過藥物控制達到較好的治療效果。直徑≤2cm的胃間質瘤多數能徹底治愈，如果沒有不良因素，甚至只需定期隨訪、觀察，復查超聲內鏡間隔時間一般在6-12個月。對于內鏡隨診困難的胃間質瘤可以考慮開放手術，對于適宜做腹腔鏡切除的可以考慮腹腔鏡切除，一般手術后可以徹底治愈。直徑≤2cm的胃間質瘤如果合并不良因素，比如邊界不規則、潰瘍、強回聲和回聲不均等，建議對胃小彎側、胃后壁、胃食管結合部進行腹腔鏡或者內鏡切除。如果直徑>2cm的胃間質瘤，只是局限性，沒有轉移，原則上可直接進行手術，患者術后根據危險度分級判斷能否徹底治愈，一般極低危和低危徹底治愈的可能性很大。但復發轉移的胃間質瘤，無論大小都比較難徹底治愈。對于這部分患者，治療的目標是延長生存，提高生活質量，而當危險度分級越高，其復發轉移的可能性就越大。靶向藥物對這類患者的控制率比較高，患者需要口服靶向藥物進行治療，比如伊馬替尼，盡可能使腫瘤不發生進展，達到帶瘤生存的狀況。相比胃癌、腸癌等，胃間質瘤的治療效果明顯更好。而靶向藥物的出現，使患者的生存時間顯著延長，患者一定要保持良好心態，積極配合醫生接受規范化的治療。