胃腸間質瘤絕大多數能夠切除的腫瘤都會考慮做手術，而做手術腹壁就會有傷口，術后疼痛往往都是傷口引起。在術前，會訓練在有腹帶保護或者是有手保護的情況下，訓練咳嗽、咳痰。早期如果是胃腸道手術后的病人，往往出現麻痹性腸梗阻，腹脹，也會引起不適，這種情況下會建議早期下床活動、翻身，胃腸道通關排氣之后，這種腹脹或者是不適的癥狀就會明顯改善。而且對于開放手術跟腔鏡手術，其實微創手術最大的優勢就是切口小，創傷小，術后病人因為沒有這些不適的情況，愿意早期活動，早期下床，所以胃腸道的功能恢復的時間也會比較短，比較快，可以早期的進食。這樣的情況下，術后的疼痛就會明顯減輕。