睡覺起來腳疼的原因有如下幾種：1、痛風：如果沒有進行任何運動，但睡覺起來腳疼，可能是患了痛風，患者應回顧是否飲用啤酒，并且食用了海鮮，可到醫院檢查血尿酸；2、風濕、類風濕疾病：考慮是否有風濕、類風濕疾病的病史；3、腳部感染：檢查腳底是否感染，如腳氣、雞眼，如果發生感染，但患者未注意到，會導致腳部淋巴管炎，最終導致丹毒，致使腳部疼痛；4、長期疲勞：回憶前段時間是否有長期行走、勞損、站立或長期穿不合適的鞋，尤其女性穿高跟鞋，經過一宿的休息，醒來后又恢復到承重狀態時，腳部會產生疼痛。