喉嚨兩側疼可能由于急性咽炎、急性咽扁桃體炎引起，具體如下：1、急性咽炎：屬于上呼吸道感染，在受涼、勞累、淋雨后，呼吸道局部免疫力降低，導致病原體入侵，發生在咽部時則會出現咽部疼痛，表現為兩側疼痛。通常是由于病毒感染引起，可以進行對癥治療，如應用含片改善癥狀，或者使用清熱、解毒的中成藥進行治療；2、急性咽扁桃體炎：由于細菌感染引起，如溶血性鏈球菌，需應用抗生素進行治療。如果在扁桃體上發現膿性分泌物，則可以確診為急性咽扁桃體炎。