同房后肛門疼痛的原因通常有以下幾方面：1、肛交疼痛：如果進行肛交，可能會在肛交的過程當中引起肛門、肛管或者直腸的刺激，可能會引起肛門或者直腸疼痛。需要注意幅度或者可能需要潤滑，帶一些避孕套等措施；2、幅度過大：如果采用陰交的性交方式，產生肛門疼痛，可能最常見的就是在性交的過程當中幅度太大，太劇烈，刺激到肛門。因為陰道和肛門相鄰，建議在抽插的過程當中減小幅度。另外盡量要采用潤滑，如果陰道比較干澀，這時可以使用潤滑液、潤滑劑或者帶避孕套等方式，一般可以緩解或者避免肛門的疼痛。