兒童基因檢測的好處與壞處具體如下：1、好處：對于部分兒童是否患病有一定的預判價值，對于患病高風險的兒童，可以進行有效的預防措施來降低患病率。對于患有疾病的兒童，通過基因檢測可以選擇有效的治療方法，控制疾病發展，通過基因檢測，還可以確定兒童與父母親的親緣關系；2、壞處：很多兒童基因檢測價格比較昂貴，目前多為自費，因此，給家庭增加了經濟負擔，并且部分檢測結果也會影響到兒童及家屬的心理，給兒童及父母都造成較大的精神壓力，并且可能會出現精神損害，臨床應該給予重視。