甲狀腺炎在臨床上有幾種類型，其中急性、化膿性的甲狀腺炎在臨床上非常少見，是細菌感染所導致。另外一種是亞急性甲狀腺炎，在臨床上相對比較多見，亞急性甲狀腺炎的病因不是太明確，有些研究表明可能與病毒感染有關，比如有些患者在感冒后或其它的病毒感染后，出現亞急性甲狀腺炎。 在臨床上最多見的叫做慢性甲狀腺炎，比如橋本甲狀腺炎，就是慢性淋巴細胞性的甲狀腺炎，病因與體內的自身免疫反應有關，體內產生了針對甲狀腺相關抗原的抗體導致甲狀腺功能破壞所引起，后期可以出現甲狀腺功能減退等。