若腎結石體積較小，直徑＜6mm，自行排出的可能性為80%，此時醫生可以鼓勵患者多飲水并增加活動。患者還可以使用能夠溶解結石的藥物，使結石更圓滑，則排出的幾率可能會增加。醫生還可給患者使用α受體阻滯劑等，使輸尿管擴張。若結石較大，患者需進行體外沖擊波碎石，隔腹壁將腎臟中的結石粉碎，配合多飲水、利尿，使結石排出體外。若體外沖擊波碎石后結石排量過大，可能會堵在輸尿管并形成石階，此時需進行經皮腎鏡或輸尿管鏡，將結石排出體外。