胃腸道穿孔后消化液溢入腹腔，主要是引起腹部劇烈疼痛，所以胃腸道穿孔主要要與腹痛的疾病進行鑒別，具體如下： 1、急性膽囊炎：引起腹痛位置主要在右上腹，表現為陣發性腹痛，或者持續性腹痛，呈陣發性加劇，且多伴有右肩部的放射痛，做腹部超聲檢查可以看到膽囊壁增厚，膽囊有結石，有些急性膽囊炎合并膽囊壞疽、穿孔時，也會引起彌漫性腹膜炎表現，與胃腸道穿孔有時會混淆，但是壞疽性膽囊炎引起穿孔，通常在腹部立位片中看不到膈下游離氣體； 2、急性胰腺炎：腹痛通常位于中上腹或者中上腹偏左位置，呈循序漸進過程，不像胃腸道穿孔會突發劇烈腹痛，而且急性胰腺炎患者，在做腹部CT時可看到胰腺的水腫，以及胰腺周圍的滲出，查血尿淀粉酶可以發現血尿淀粉酶有升高； 3、急性闌尾炎：胃、十二指腸小穿孔的患者，消化液通過右結腸旁溝流到右下腹，引起轉移性右下腹痛，有時候和急性闌尾炎很難鑒別，但是這類患者的腹部體征通常比急性闌尾炎更厲害，除了右下腹有壓痛，往往壓痛最明顯的部位是在上腹部，而急性闌尾炎患者的壓痛主要位于右下腹，而且做腹部立位片檢查時，闌尾炎沒有膈下游離氣體，而胃腸道穿孔可以看到膈下游離氣體。