蛛網膜囊腫是由蛛網膜包繞腦脊液形成的囊性病變，實際上是蛛網膜在異常病變情況下，導致腦脊液循環不通暢，局部形成的囊腫。在發生機理上大概分為先天性和后天性兩個原因。內鏡手術大多數采取囊壁與腦池的造瘺術，將囊壁撕開口后與正常的腦脊液循環溝通，讓囊液流到正常腦脊液里形成循環。 但手術撕開瘺口的部位，在將來如果遇到外傷、感染、腫瘤、出血等繼發性蛛網膜囊腫形成的原因時，還會發生粘連，可能導致造瘺口閉合。而當其完全閉合的時候，蛛網膜囊腫又會復發，又會產生新的囊腫，有些囊腫的體積甚至比之前的囊腫更大。