良性卵巢囊腫，CA125通常不會升高。CA125，通常用于區別卵巢腫物的性質，卵巢的上皮性腫瘤，CA125升高較為明顯，良性腫瘤，CA125通常不會升高。在臨床上，如果發現卵巢上長東西，給病人進行腫瘤標志物篩查的目的，是區分物質為良性或惡性。這種檢查只是參考，不能100%的確定腫瘤的性質，但是良性腫瘤通常不會升高。除了惡性腫瘤以外，在臨床上還有其他情況也會引起CA125升高，如卵巢巧克力囊腫、子宮內膜異位、子宮腺肌癥等，皆會引起CA125升高。慢性炎癥時，也會引起 CA125升高，但是升高通常是一時性升高，而且升高水平并不高。