卵巢癌早期較難發現，如果早期發現，CA125未必會升高。多數卵巢癌早期沒有癥狀，如果患者出現癥狀，則卵巢癌細胞已經擴散到盆腹腔或腹膜，出現大量腹水，或者胸水、胸腹水。這時患者的CA125會升高，大于500U/mL，甚至更高。 少數患者為良性囊腫，比如子宮內膜異位囊腫，俗稱巧克力囊腫，良性囊腫即使做手術以后也容易復發。部分醫生或者患者更愿意做隨訪觀察，隨訪中巧克力囊腫會導致CA125輕度升高。如果B超發現囊腫中有實質性成分，或者CA125升高明顯，會考慮囊腫發生癌變。因此對于這類患者，CA125升高會在早期發現。