確診傷寒最可靠的依據是病原學診斷，傷寒是由傷寒沙門氏菌感染引起的一種腸道疾病，所以無論血液、骨髓，還有糞便，只要能培養出傷寒沙門氏菌屬即可確診此疾病，故病原學檢出是確診金標準。對于一種疾病，不能單靠一個檢查確定，在疾病診斷過程中，需要根據臨床表現和輔助實驗室檢查進行最后綜合診斷。 傷寒是一種傳染病，因此需結合患者是否發生在流行季節，以及是否到過疫區、是否有不潔食物史等進行綜合考慮，比如太原理工大傷寒流行，第一個病例特別嚴重，患者確定診斷后，相繼有同校區的同學過來就診，便很容易診斷為傷寒，因為其符合流行病學資料，比如發生在流行季節、來自流行地區，有發熱、傷寒面容、玫瑰疹、白細胞水平降低、有嗜酸細胞比例降低、肝脾腫大、肥達氏反應陽性等典型傷寒臨床表現。