幽門螺桿菌根除后，一般建議進行C13或者C14呼氣試驗，進一步排查是否根除。不建議選用幽門螺桿菌抗體進行復查，因為幽門螺桿菌抗體陽性病人，即使進行根除治療，其血清中的抗體也可能持續存在較長時間，此時如果抽血查抗體，結果仍然呈陽性，不代表細菌沒有根除，所以不作為判斷是否更除的檢查手段。另外應注意復查時間，應停用抗生素1個月后，再停用PPI(質子泵抑制劑)，如奧美拉唑、雷貝拉唑，泮托拉唑、艾司奧美拉唑、蘭索拉唑等。至少停用鉍劑2周左右，如枸櫞酸鉍鉀、膠體果膠鉍等。還應注意停用具有殺滅幽門螺桿菌作用的中成藥，至少2周以上，才能進行C13或者C14呼氣試驗檢查，否則上述藥物可能會對吹氣結果產生影響。可能因近期使用抗生素或者PPI類藥物，出現假陰性的情況，所以無法判斷是否根除，因此應停用上述藥物一段時間后，再進行復查。