在腸道準備前應吃1天的少渣半流質或流質飲食，盡量避免含有高蛋白質、高脂肪的食物，避免產生蛋白質泡沫，影響腸鏡檢查，盡量少吃綠葉蔬菜，帶果皮、果殼的水果。可以選擇無痛、舒適的腸鏡，也可以選擇普通腸鏡，無痛腸鏡是在麻醉下進行，檢查較為安全，患者不會感到痛苦。進行腸鏡檢查，瀉藥通常在腸鏡檢查前4-6小時全部服用，清空腸道后再進行腸鏡檢查，此時腸道比較干凈，無泡沫，無食無殘渣。如果腸道準備時間過長，比如12小時以上，進行腸鏡時腸道中小腸分泌的黏液，即腸液已經流入大腸，影響觀察。腸鏡檢查通常10-30分鐘可以完成，安全性較高。