多重耐藥菌可能會傳染給其他人，多重耐藥菌的種類較多，包括結核菌、葡萄球菌及大腸埃希菌等，由于菌種不同，傳染途徑也存在差異。多重耐藥的結核菌主要通過呼吸道傳播，而部分則是通過消化道傳播。由于傳播途徑存在差異，所以預防多重耐藥菌傳染時，預防的重點也會有所不同。若屬于呼吸道傳播的多重耐藥菌，應強調佩戴口罩并進行呼吸道隔離。若耐藥菌通過消化道傳播，應在飯前、便后以及接觸病人后及時洗手。若周圍人患有多重耐藥菌感染，應給居室定時通風、定期消毒衣物，并在接觸病人后洗手，以避免被傳染。