血清低密度脂蛋白膽固醇偏低，本身是膽固醇的一種，常見還是血清低密度脂蛋白膽固醇偏高人群。如果是偏低，需要找到原因，是什么東西導致血脂消耗增加，或血脂合成減少。低密度脂蛋白膽固醇主要是在肝臟合成，如果有肝臟慢性疾病，如肝硬化或慢性酒精性肝病，都可以導致低密度脂蛋白膽固醇合成減少，從而使血里膽固醇降低。 另外，如果長期素食，油脂攝入減少，也可以使低密度脂蛋白膽固醇偏低。還有人有內分泌疾病，如甲狀腺功能亢進癥。甲狀腺激素是全身性代謝激素，可以使脂肪燃燒增加，可以使低密度脂蛋白膽固醇降低。使用他汀類降脂藥的患者，如誤用他汀類降脂藥，可能也會導致低密度脂蛋白膽固醇降低。還有自然界也有天然他汀類物質，如紅曲米，如果長期攝入紅曲米，也可能會導致低密度脂蛋白膽固醇偏低。