血清高密度脂蛋白膽固醇偏低，因肝臟肝細胞合成的載脂蛋白A1和低密度脂蛋白偏低引起，因為血清的高密度脂蛋白，主要是肝臟合成的載脂蛋白A1，其與一些血脂成分結合從而形成了高密度脂蛋白。因為載脂蛋白A1是高密度脂蛋白里面最重要的成分，此種成分在肝臟合成，隨著年齡的增加，高密度脂蛋白的合成會下降，因此高密度脂蛋白偏低或者高密度脂蛋白膽固醇偏低，在臨床上很常見，特別是在老年人群中。高密度脂蛋白膽固醇是對人體有利的膽固醇，因為高密度脂蛋白可以到外周組織，把外周組織的膽固醇運回到肝臟代謝，所以認為高密度脂蛋白是一個抗動脈粥樣硬化的脂蛋白，可以使動脈血管發生動脈粥樣硬化的概率下降。但在臨床上，高密度脂蛋白偏低很常見，高密度脂蛋白偏低時，需要給予藥物治療。目前治療高密度脂蛋白偏低的藥物主要是他汀類藥物、貝特類藥物、煙酸類藥物，上述藥物都具有升高高密度脂蛋白膽固醇的效果，大概升高10%。