臨床上為了檢查出食管癌，可以通過詳細的體格檢查、影像學檢查以及內窺鏡的檢查和病理學細胞學的檢查，來最終發現食管癌。食管癌的患者可能會出現食道局部的疼痛癥狀，進食后梗阻的癥狀，可以做詳細的體格檢查，來發現是否有局部的壓痛以及頸部鎖骨上等部位的淋巴結轉移。除此之外，還需要做胸部的加強CT以及腹部加強CT等多項檢查，來評估患者具體的臨床分期。對于CT檢查有異常的患者，例如食道壁增厚的情況，則建議進一步做胃鏡檢查。在胃鏡下可以直觀地觀察到食管癌的具體病變的類型，是潰瘍型還是腫塊型，并且還可以在胃鏡下做癌組織的穿刺活檢檢查。而對于活檢后的組織，可以做病理學或細胞學的檢查，來明確局部病灶的具體性質以及癌癥的類型，是腺癌還是鱗癌。