診斷食道癌主要有兩種檢查方式，即鋇餐造影和食管鏡檢查。臨床常見的手段，也是運用最豐富的手段是食管鋇餐造影，但是獲取的信息比較局限，也不能獲得病理組織進行最終診斷，僅為食道癌的篩查方式。 目前臨床運用更多的是內窺鏡檢查，即胃鏡檢查，早期食道癌通過染色、放大、NBI檢查，可以對局限于黏膜層的早期食道癌進行診斷；診斷中晚期食道癌的優勢更加明顯，此時患者會出現蕈傘型、隆起型、潰瘍型病灶，食道鏡進去后可以清晰直觀地對其部位、性質、形態進行觀察。同時可以在內鏡直視下取得病理組織，送到病理科在顯微鏡下進行病理診斷，此為食道癌檢查的金標準。