目前檢測幽門螺桿菌的無創方法主要是碳13和碳14呼氣試驗，這兩種檢測方法的特異性比較高、比較廉價，而且是無創操作。最適合兒童的呼氣試驗是進行碳-13呼吸試驗，該項檢查建議在空腹或者餐后兩小時進行，患兒口服一顆含有標記碳13的尿素膠囊，靜坐15-20分鐘以后，對專門的吹氣卡進行吹氣，留取測試樣本。將收集樣本的呼氣卡放到專門的檢測儀器中，讀取相應數值，最終可以全面檢測出受檢者胃內是否含有幽門螺桿菌。 但需注意在進行該項兩種檢查前，受檢者應該避免服用抗生素、質子泵抑制劑，如奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑或者膠體鉍，以免造成檢查結果的假陰性，因此如果服用以上藥物需要暫停半個月以上再進行檢測。如果只是想明確孩子是否感染幽門螺桿菌，則沒有必要進行幽門螺桿菌檢測，除非高度懷疑患兒存在消化性潰瘍、MALT淋巴瘤或者HP相關性疾病，此時則需要進行幽門螺桿菌檢測和治療。