肝結石是指肝內膽管結石，如果病情發展到比較嚴重的階段，有可能會出現肝膿腫、肝纖維化、肝硬化以及肝臟惡性腫瘤。肝內膽管結石是由于膽道梗阻、膽道內異物、某些先天性炎癥因素或者是結石，都會導致肝內膽管進一步狹窄、炎癥進一步加重，繼而出現膽道擴張，而淤滯的膽汁會反流入血，有可能合并有黃疸。反復的炎癥刺激會引起膽道閉塞，特別是受累膽管周圍的肝臟會表現出纖維化、肝硬化，長期刺激膽管壁會形成膽管細胞癌，而嚴重的肝硬化，特別是彌漫性肝內膽管結石，會表現為肝功能衰竭，繼發門靜脈高壓癥表現為黃疸、腹水、脾大，食管-胃底靜脈曲張、破裂等。膽道梗阻也會繼發細菌感染，表現為肝內的膿腫，會出現明顯的腹痛，發熱、寒戰等癥狀。