如果肛門出現強烈疼痛，除治療肛門局部疾病以外，可以采取肛門局部的溫水坐浴。溫水可以使肛門括約肌痙攣得到緩解，降低肛門局部靜息壓，壓力下降可以有效緩解疼痛。此時可以應用局部鎮痛藥物，比如表面麻醉劑，包括奧布卡因凝膠、利多卡因凝膠，局部涂抹也可以使疼痛得到緩解。肛用栓劑，比如吲哚美辛栓，或者雙氯芬酸鈉栓塞入肛門，通過經直腸給藥的方式，也具有較好的療效。口服非甾體抗炎藥，比如布洛芬或者雙氯芬酸，對于疼痛的緩解效果也不錯。強效的鎮痛藥物，包括杜冷丁或者嗎啡，既可以口服，也可以注射，但這類阿片類藥物在門診難以獲得。經上述局部鎮痛治療，如果效果不佳，也可以到疼痛門診，予以局部浸潤麻醉等治療，或者應用鎮痛泵，但鎮痛泵也需要在住院的情況下才可以獲得。