腘窩囊腫是因腘窩部滑膜囊異常分泌滑液發生自我膨大，如果采取穿刺方法將滑膜囊內積液抽出，腘窩囊腫暫時變小，不會影響膝關節屈膝以及下蹲等功能。一段時間后滑液可能導致腘窩囊腫變大，此時還可以繼續采取穿刺方法抽出積液。此類治療方法可以反復多次，直到腘窩囊腫積液消失。后期腘窩囊腫積液可以變為果凍狀，此時再考慮手術治療。 腘窩囊腫屬于肢體包塊，一般肢體出現包塊時先考慮進行手術切除。腘窩囊腫患者可以不開刀進行治療，例如身體狀況不適合手術治療或患者年齡較小，可以暫時采取保守治療方法。