通常進行胃腸鏡檢查需要空腹，且在腸鏡檢查前還需進行腸道準備。通過服用清潔腸道藥物，將大便完全排出體外直至排出清水樣便，即呈水樣、并無任何糞質或糞渣狀態。因將胃腸道完全排空后進行胃腸鏡檢查時，能夠更好觀察胃及結腸黏膜情況，可以更好發現并進一步治療相關病變。如果進食后進行胃鏡檢查，此時因胃黏膜均被食糜覆蓋，可能無法觀察到胃黏膜情況。如果并未進行腸道準備，腸鏡進入腸道后只能觀察腸腔內糞便，可能無法觀察腸道情況。此外，患者進行胃鏡檢查時，可能誘發惡心、嘔吐等不適，在檢查過程中，如果出現胃內容物反流進入氣道，則易引起氣道窒息，嚴重時可能危及生命。