直腸鏡跟腸鏡不完全一樣。腸鏡主要包括肛門鏡，也叫直腸鏡，還包括乙狀結腸鏡、電子纖維結腸鏡及小腸鏡，所以腸鏡是檢查的總稱。而直腸鏡僅僅就是肛門鏡，檢查的主要范圍是在肛管及直腸10公分以內的這段腸管，無法檢查直腸以上的部分，主要可以發現痔瘡、肛乳頭瘤、直腸息肉、直腸炎、直腸肛管腫瘤等常見疾病。而腸鏡包括小腸鏡、結腸鏡、乙狀結腸鏡、肛門鏡。不同病情的需要，會選擇不同檢查。如果懷疑是小腸出血、小腸腫瘤，需要做小腸鏡，如果懷疑是結腸炎癥或結腸腫瘤，需要做普通的電子結腸鏡，這就是兩者的區別。