由于目前技術與設備的發展，很多從前需要做角膜移植的圓錐角膜，現可以不需要通過角膜移植來采取治療?，F在將角膜膠原交聯技術和角膜硬性接觸鏡技術相結合，可以控制早期圓錐角膜的發生和發展，能夠使大部分圓錐角膜在相當長的時間內保持穩定。目前只有到完成期的圓錐角膜或角膜突發后彈力層破裂、角膜水腫引起嚴重視力下降時，才考慮做角膜移植。 如果角膜的后彈力層完整，可以用深板層尤其是大氣泡輔助的深板層角膜移植術完成。這樣可保留病人角膜的內皮層，手術以后排斥反應的發生率非常低。如果是角膜后彈力層破裂，或角膜瘢痕比較重、比較深，這時只能通過穿透性角膜移植控制圓錐角膜。 與其它疾病的治療方式的不同在于，大部分圓錐角膜可以通過深板層角膜移植控制，少量可以用穿透性控制，而且由于其不是炎癥性反應，而是變性性疾病，術后排斥幾率相比其它疾病低很多。