腦干腫瘤的治療難度系數較大，但每年有很多成功的案例。需根據侵犯部位、性質判斷是否能做手術，比如膠質瘤，是彌漫性生長，侵犯了腦干神經核團的神經組織，若切除后患者會有嚴重的神經功能損傷，很難做到徹底清除，不建議手術；若是良性腫瘤，比如海綿狀血管瘤、界限輪廓明確的低級別膠質瘤，可通過神經外科纖維技術、DTI影像等判斷，可把腫瘤做到完整切除，對周圍的重要神經核團和纖維素做到很好的保護作用。