腦干腫瘤手術主要根據腫瘤部位來手術方式，即腫瘤接近哪個部位，就選擇最接近腫瘤的通路進行選擇手術入路。若位于中腦，可進行顳枕開顱，額顳頂開顱，或Poppen三角區入路；若位于橋腦，可進行CPA開顱、后路正中開顱、顳枕開顱等；若位于延髓，可進行后正中切口入路、一側入路、遠側入路、CPA入路等。腦干腫瘤手術位置非單一固定，而是由病變的具體部位決定。