無創DNA與羊水穿刺各有優勢。無創DNA主要用于檢查染色體數目是否異常，在21-三體檢查方面，準確率較高，可以達到99%左右，只通過抽血即可得到結果，是一種無創操作；羊水穿刺主要用于診斷染色體數目和結構是否異常，是一種有創操作，具有流產風險。如果僅檢查染色體數目是否異常，可以選擇無創DNA，但羊水穿刺的診斷結果較為準確且較完整。