鋇餐與胃鏡的區別顯而易見，胃鏡沒有廣泛用于臨床之前，鋇餐使用較多。鋇餐是服用一定劑量鋇劑后進行拍片觀察的方法，可間接反映胃腸道病變，但因鋇劑充盈情況不同，可能發生漏診的情況，且不能發現某些細微部位的病變。自從胃鏡應用于臨床后，內鏡技術越來越好，可操縱性和患者接受度大幅提高，目前已廣泛用于臨床診斷。胃鏡可直觀觀察黏膜病變，且可以進行活檢，隨著染色內鏡和放大內鏡的發展，可通過放大或染色更細微、精確地觀察病變部位，幫助發現早期胃癌、腸癌等。