鋇餐透視和胃鏡是兩種不同的操作，各有優勢和適應癥。鋇餐是飲用鋇劑后，在放射科進行拍片放射檢查，主要觀察消化道整體輪廓，如賁門失弛緩的患者食管下段縮窄，呈鳥嘴樣改變，而食管上段呈擴張樣，食管外輪廓較寬。胃鏡檢查要觀察食管腔內，對于食管擴張的判斷不如鋇餐準確。但是胃鏡能夠清晰觀察食管黏膜和黏膜表面細小糜爛、充血、出血點以及淺表潰瘍，而鋇餐檢查無法發現。 此外，鋇餐檢查只能進行觀察，無法對病變進行活檢；而胃鏡可以在觀察到病變的同時，用活檢鉗取病變部位組織送病理科，病理科醫生在顯微鏡下進一步判斷，可對疾病做出最準確的診斷。