肛瘺的傳統治療方法為切開或切開掛線，將肛門周圍的肌肉，部分切開或切斷，導致肛門功能損傷，甚至嚴重時引起大便失禁。微創治療肛瘺方法較多，可通過封堵其內口、填充其管道，保留局部的肌肉，達到治療肛瘺的目的。微創治療雖有優勢，但也存在弊端，其成功率較傳統手術低，優點為可保護肛門周圍的肌肉，使肛門功能的損傷降至最低，避免大便失禁或肛門功能損傷。