肛瘺手術后，中醫醫院需換藥、坐浴以及儀器治療；西醫的治療為換藥及儀器治療。臨床的護理主要包括坐浴及藥物濕敷，操作相對較簡單。 若患者進行植入性手術，需將生物材質植入體內，術后坐浴時間需盡量晚些。同時，術后恢復正常飲食以及排便的時間，也需相應推遲，一般需推遲48-72個小時。若患者進行傳統手術，術后24小時患者即可進行正常的飲食、洗澡、坐浴，以及局部濕敷藥物、理療等。