肛周膿腫是除了痔瘡之外發病率最高的一種肛腸疾病。常見的肛周膿腫最主要的原因為肛門感染，感染分成兩種類型，第一種是腺源性的感染，就是通常講的肛門周圍肛腺組織感染，細菌等這些感染的因素向周邊進行蔓延，形成膿腫。大概80%-85%以上的肛周膿腫都是腺源性的感染。第二種叫做非腺源性的感染。分為局部的或者全身的，比如說局部的毛囊炎、汗腺炎或者是囊腫感染；也有醫源性的或者是外傷性的，由于不慎摔傷或者劃傷，導致肛門周圍的組織或者肌肉感染。全身性是比較特殊的，就是通常講的炎癥腸病，如克羅恩病。肛門周圍肛管的惡性腫瘤也可能引起肛周膿腫。