肛瘺必須通過手術才能治愈。肛瘺有一個內口，一個外口，內外口之間還有一個瘺管。手術時要處理好內口，還需要完整地分離出內外口之間的瘺管，這樣才能徹底治愈肛瘺。當然部分肛瘺的內口處于高位，或者瘺管比較復雜，且并未經常發作，不常出現炎癥，因為做切除手術切除組織較多，肛門的功能會因此受到影響，這時可以暫時先觀察不做手術。當然在觀察的過程中，需要注意瘺口是否有出現一些變化，極少數情況可能性會癌變，所以即使不做手術，也要定期到專科去檢查。